Para murid Alola yang megunjungi wilayah Kanto bertemu dan bertarung di gym battle. Mallow dan Lana melawan Misty serta Kiawe dan Lillie melawan Brook. Pertarungan epic pun terjadi antar teman-teman Ash, bahkan bentorkan antara Mega Evolusi melawan Z-Move pun terjadi!.
Ryu
tanpa sengaja bertemu dengan roh jahat yang bernama Tokageroh, dan
Tokageroh sendiri membuat masalah dengan teman-teman Ryu serta mengambil
pedang milik Amidamaru dulu, Harusame. Untuk menyelamatkan Ryu, Yoh
harus memilih untuk menghancurkan tubuh Ryu atau harus menghancurkan
pedang Amidamaru.
Adam mampu bersaing dengan Zeus, Brunhilde mengatakan bahwa sumber utama dari kekuatan Adam berasal dari kebenciannya kepada para dewa. Adam dan istrinya, Eve, yang dulu pernah diusir dari surga karena memakan buah terlarang disana. Akan tetapi, Zeus yang marah akhirnya menunjukkan kemampuan dan wujud terkuatnya.
Setelah kekalahan pertama di Gym Kota Santalune, Satoshi mulai ragu apakah dia bisa mengalahkan Viola di pertandingan ulang selanjutnya. Serena mengingatkan dan memberi semangat kepada Satoshi untuk tidak putus asa sampai akhir, kata-kata Serena ini memberikan semangat kepada Satoshi dan untuk melakukan sebuah latihan khusus kepada Pikachu dan Fletchling melawan Noivem milk Alexa.
Ryu yakin bahwa dia tidak akan pernah bisa menjadi seorang shaman seperti Yoh. Hal ini membuat Ryu murung, teman-teman Ryu yang saat ini sedang berkumpul di tempat bowling tidak berpenghuni untuk membahas masalah Ryu. Dan ternyata disana terdapat roh jahat yang bernama Tokageroh yang ingin membalas dendam kepada Amidamaru.
Pertarungan Zeus Vs Adam dimana Adam dibantu oleh saudari ketujuh dari Valkyrie, Reginieif, Sedangkan Zeus hanya menggunakan tangan kosong. Zeus lebih unggul karena merupakan dewa yang biasa bertarung dan unggul diawal pertarungan sampai Adam bisa menggunakan kemampuan menghindar dan meniru semua serangan lawannya.
Yoh dan Manta bertemu seorang pengelana muda bernama Horohoro yang menggunakan pakaian salju meskipun saat ini sedang musim panas dan membawanya ke rumah. Ternyata Horohoro juga bisa melihat roh dan seorang Shaman yang memimpikan dunia dimana koro-pok-guru hidup bersama manusia bersama-sama dan damai. Anna khawatir bahwa Horohoro merupakan Shaman yang ingin mengeliminasi lawannya sebelum Shaman King dimulai.
Satoshi dan kawan-kawan akhirnya tiba di Kota Santalune, Clemont dan Bonnie tidak tahu pasti dimana lokasi Gym tersebut, untungnya ada seorang fotografer yang membantu mereka menunjukkan lokasi gym tersebut dan disana mereka bertemu lagi dengan Alexa yang sedang menunggu saudari nya. Dan ternyata fotografer yang menolong mereka sebelumnya ialah, Viola yang Gym Master di kota tersebut.
Setelah kekalahan Lu Bu, diketahui bahwa valkyries yang menjadi senjata para petarung juga ikut hancur dan hilang. Goll dan Brunhilde yang marah memilih petarung selanjutnya yaitu ayah dari semua manusia di bumi, Adam, sebagai petarung di pertarungan kedua ragnarok. Sedangkan dari pihak dewa yang maju adalah Zeus!.
Setelah pertarungan melawan Pai-Long, Ryu si pedang kayu memutuskan utnuk menjadi seorang Shaman juga. Ryu meminta Yoh menajdi Mentor nya, tapi Anna meminta uang sewa kepada Ryu sebagai bayarannya. Beberapa hari kemudian, muncul la Gei Yin yang merupakan salah satu Shaman dari keluarga Tao yang baru saja tiba dari Cina dan ingin melawan Yoh.
Serena akhirnya memilih pokemon starternya guna untuk mewujudkan impiannya menjadi trainer pokemon yang handal dan langkah awal bertemu dengan Satoshi. Ditempat lain, Satoshi dan kawan-kawannya melanjutkan perjalanan menuju gym pertama, Bonnie sangat menyukai pokemon, dia juga memandikan Pikachu dan membersihkan sayap Fletching, tapi tiba-tiba muncul pokemon yang mencuri makanan mereka, Dedenne.
Satoshi menelepn Profesor Oak bahwa dia berhasil mendapatkan pokemon pertamanya di Kalos yaitu Froakie. Lalu Satoshi meminta Clemont dan Bonnie untuk ikut menuju Santalune Gym. Saat diperjalan mereka bertemu Dedenne liar yang berusaha mengambil berry di pohon, Bonnie memutuskan untuk mendapatkan Dedenne namun di ganggu oleh pokemon burung liar, Fletching, yang mencuri berry milik Dedenne. Namun Satoshi juga ingin menjadikan Fletching sebagai pokemonnya.
Manta berusaha untuk mencari pedang yang lebih baik untuk digunakan oleh Yoh, tapi sialnya Manta bertemu dengan anggota gang yang tidak ingin membantu nya dan bahkan mengganggu Manta. Untung ada Ryu yang menolong Manta, Ryu meminjamkan pedang kayunya untuk digunakan Yoh bertarung melawan Pai-Long. Akan tetapi Pai-Long berubah menjadi burtal dan menyerang siapa saja.
Kaki Lu Bu mengalami cidera yang luar biasa sehingga patah oleh serangan maha dahsyat milik Thor. Tapi rekan bertarung Lu Bu, sang kuda, memberikan semangat sehingga Lu Bu bangkit kembali. Lu Bu teringat akan masa lalunya dan tidak berhenti berlatih demi menemui lawan yang tangguh. Kali ini Lu bu bangkit dan siap melancarkan serangan terkuat dan terakhir miliknya, akhir pertarungan pertama Ragnarok, Thor Vs Lu Bu.
Satoshi membawa Froakie yang terluka untuk diobati, di pokemon center inilah Satoshi dkk bertemu dengan Professor Sycamore dan mengetahui mengenai Mega Evolusi. Mega Evousi merupakan evolusi lanjutan dimana sang pokemon masih bisa kembali ke wujud sebelumnya. Satoshi pernah bertemu satu yatu saat dibandara ketiak ia pertama kali datang ke Kalos, yaitu Mega Blaziken. Saat ada kekacauan di tempat professor Sycamore, Serena melihat Satoshi di TV.
Manta mengajah Yoh, Anna dan Amidarmaru menonton film idolanya, sang kungfu master di era Jepang dahulu. Saat mereka selesai menonto, tiba-tiba Jun datang dengan roh nya dan menantang Yoh bertarung. Yoh kewalahan melawan roh milik Jun yang ternayata merupakan idolanya Manta .
Satoshi, Pikachu dan Alexa yang menaiki pesawat sedang menuju ke sbuah wilayah baru yang bernama Kalos. Kali ini Satoshi sangat antusias dan ingin sekali bertemua para champion di wilayah ini. Setibanya di Kalos, ternyata saudari Alexa yang juga seorang Gym Leader tidak ada di kota Santalune. Satoshi ingin mendapatkan lencana pertamanya dan menuju Kota Lumiose.
Gadis yang diperlihatkan di episode sebelumnya merupakan tunangan Yoh, Kyoyama Anna. Dia memutuskan untuk melatih Yoh dalam pertarungan Shaman Fight yang biasa diadakan selama 500 tahun sekali, dan kali ini diadakan di Tokyo. Latihan dari Anna amatlah berat guna menjadikan Yoh sebagai pemenang dari Shaman Fight.
Sebelum dimulainya ragnarok, Brunhilde memanggil saudarinya yang keempat, Randgriz, dan meminta dia membantu Lu Bu dengan cara berubah menjadi senjata rahasia dan digunakan Lu Bu saat bertarung. Lu Bu berhasil melukai Thor, Dewa Zeus menganggap bahwa Valkyries berani menantang dewa. Sementara itu Thor mengeluarkan semua kemampuannya untuk mengalahkan Lu Bu.
Para dewa di arena semuanya terkejut kalau Lu Bu bisa memaksa Thor untuk bertarung serius, disaat pertarungan berlangsung ada juga flashback mengenai masa lalu Lu Bu, mengenai kenyataan yang tidak pernah diungkap dalam sejarah manusia. Suatu hari Lu Bu menyerah karena tidak ada lagi lawan yang kuat yang bisa dilawan di dunia dan dia sangat senang bisa bertarung melawan Thor.
Dalam pertemuan untuk menentukan "kelangsungan hidup umat manusia" yang diadakan di dunia langit di tempat para dewa tingal di setiap seribu tahun sekali, para dewa berkumpul di Valhalla memutuskan untuk pemusnahan umat manusia.
Ash kembali ke region Kanto bersama teman-temanya dari Alola, Professor Kukui mempunyai projek sekolah khusus mengenai perbedaan pokemon di region Kanto dan Alola. Di bandara sudah menunggu teman lama kita, yaitu Misty dan Brock. Di region Alola, mereka berkeliling dan melihat berbagai pemandangan serta pokemon yang jarang mereka temui, tidak lupa Ash juga bertemu dengan pokemon-pokemon lama nya yang ada di region Kanto.
Dan menceritakan mengenai pertengkarannya dengan Drago ke teman-temannyaa. Keesokkan harinya teman sekelas Dan yang bernama Ryo mendapatkan Doom Card dari Masqurade dan meminta Ryo untuk bertarung melawan Dan. Saat pertarungan Dan sadar bahwa dia salah karena hanya mementingkan kemenangan saja tanpa memikirkan perasaan Bakugan.
Usagi mengetahui bahwa Mamoru tidak memiliki ingatan mengenai masa lalunya, hanya dengan kekuatan silver kristal, maka ingatannya bisa kembali. Usagi akhirnya memutuskan untuk menemukan kristal teraebut demi mengembalikan ingatan Mamoru.
Masquerade muncul kembali dan memberikan sebuah kartu Doom kepada seorang Brawler. Sementara itu Dan dan Drago berlatih agar bisa mengalahkan Masquerade, menurut Marucho pertandingan antara Dan Masquerade itu seimbang karena kemampuan si Drago. Di saat yang sama Runo bertemu dengan Bakugan baru yang bisa berbicara, Tigrera .
Tuxedo bertopeng akhirnya berani menampakkan dirinya di publik, dan menyatakan bahwa dia adalah kriminal yang akan menemukan Kristal Perak Legendaris. Luna dan para Sailor pun ikut menyelidiki hal tersebut, sementara itu Dark Kingdom menggunakan kesempatan ini untuk mencuci otak para manusia untuk melakukan hal yang sama.
Saat pergi ke sekolah, Dan memamerkan ke teman-temannya bahwa Drago bisa berbicara, namun Drago panik dan kabur, akhirnya ditahan oleh guru Dan. Sementara itu Dan bertemu Runo dan memberi tahu bahwa dia kalah bertarung melawan Masquerade dan kehilangan bakugan miliknya.
Kehidupan Dan Kuso berubah saat suatu hari ketika kartu acak jatuh dari langit dimana ia dan teman-temannya menciptakan permainan yang disebut Bakugan. Bersama dengan teman-temannya yang bernama Runo, Marucho, Julie, Shun dan Alice. Mereka bersama dan memperjuangkan nasib Vestroia (Dimensi Rumah Bakugan Itu).
